С самого начала Великой Отечественной войны в 1941 году Бауыржан попал в состав вновь организованной в Алматы 316 стрелковой дивизии под командованием генерал-майора И. В. Панфилова. На фронте он был командиром батальона, полка. В последние годы войны он руководил гвардейской дивизией.
В годы войны Бауыржан Момышулы отличился исключительным героизмом и мужеством, а также особым мастерством ведения военных действий.
Его подвиги описаны:
1.А. Кривицкий.”Во веки не забуду ”
2.Д.Онегин.”На дальних подступах”
3.М.Габдуллин.”Мой фронтовые друзья”
4.А.Нуршаихов.”Истина и Легенда”
5.А.Бек.«Волоколамское шоссе»
